Визначення пептидного зв'язку

Термін " зв'язок" має декілька варіантів використання: в даному випадку ми зацікавлені в посиланні на його значення як об'єднання або зв'язок між різними елементами. Пептид , з іншого боку, пов'язаний з пептидами : молекулами, які утворюються ковалентним об'єднанням амінокислот (органічні речовини, молекулярний склад яких має карбоксильну групу і аміногрупу).

Вона називається пептидним зв'язком з хімічним зв'язком, що встановлюється між карбоксильної групою амінокислоти і аміногрупою іншої амінокислоти . Цей вид зв'язку, де втрачається молекула води , дозволяє утворення вищезазначених пептидів і білків .

Після зв'язування аміногрупи ( -NH2 ) і карбоксильної групи ( -COOH ) з втратою молекули води встановлюється зв'язок CO-NH . Розвиток цього зв'язку завжди потребує внеску енергії ; У свою чергу, коли пептидний зв'язок розривається, відбувається вивільнення енергії.

Розрив пептидного зв'язку може відбуватися шляхом гідролізу : це називається розщепленням, яке молекула записує через воду. Гідроліз, в природному середовищі, відбувається дуже повільно, хоча можна прискорити процес з використанням різних методик .

У присутності води пептидний зв'язок може бути розбитий на величину вільної енергії, яка становить близько 8-16 кДж / моль (що еквівалентно 2-4 ккал / моль). Одиниця кілоджюля на моль , яка може бути символізована як kJ / mol , визнається Міжнародною системою одиниць ( SI ) і відповідає співвідношенню між енергією та кількістю речовини : енергія виражається в кілоджоулях, а речовина вимірюється у кротах

Кілоджоули - це не більше тисячі джоулів , інша одиниця вимірювання, визнана Міжнародною системою, оригінальною назвою - джоуль і використовується для вимірювання тепла, роботи та енергії. У технічному плані його визначенням є "обсяг роботи, що виконується ньютоном з постійною силою вздовж лічильника в напрямку зазначеної сили". Моль , з іншого боку, використовується для вимірювання кількості даної речовини і є частиною семи основних фізичних величин СІ.

Щоб прискорити гідроліз пептидного зв'язку, який в природі може зайняти більше тисячоліття, вчені можуть вибрати один з наступних методів :

* кислотний гідроліз : це досягається залишенням білка в киплячому протягом тривалого часу з сильними розчинами типу кислоти (H2SO4 і HCI). Цим шляхом досягається повне руйнування триптофану і частини треоніна і серину;

* основний гідроліз : його зазвичай проводять, використовуючи BaOH або NaOH, і не руйнують амінокислоти, згадані в описаному вище способі;

* ферментативний гідроліз : у живих істотах цей спосіб деградації пептидних зв'язків є найбільш нормальним. У цьому випадку протеолітичні ферменти, які діють повільно і часто не завершують свою роботу, але не відбувається ні руйнування амінокислот, ні рацемізація (коли оптично активне з'єднання стає рацемическим). Цей тип гідролізу дуже специфічний;

* гідроліз за температури : якщо умови нормальні, то пептидні зв'язки не руйнуються, але білок може бути денатурований (тобто його вторинні, третинний і четвертинні структури порушені). З іншого боку, якщо температура вище 110 ° застосовується протягом 48 годин, можна зруйнувати ланки.

Слід зазначити, що, загалом, пептидний зв'язок представлений у вигляді одинарної зв'язку . У будь-якому випадку, він має кілька особливостей, які роблять його близьким до подвійного зв'язку. Ось чому фахівці зазвичай згадують, що пептидний зв'язок має властивості, які ставлять її на півдорозі між єдиним зв'язком і подвійним зв'язком.

border=0

Пошук іншого визначення